viernes, 15 de marzo de 2013

PRODUCCIÓ MICROBIANA D'ANTIBIÒTICS


Eduard Pujol
Javier Parra
Elías Pecho

Què són els antibiòtics?

Podem definir els antibiòtics com a substàncies produïdes per bacteris i fongs, les quals tenen la capacitat d'atacar altres bacteris. Aquestes substàncies interfereixen en algun dels passos del metabolisme dels bacteris, causant-ne la mort o impedint-ne el creixement. L'eficàcia dels diferents antibiòtics pot variar molt d'un grup a un altre. 

Els antibiòtics poden causar diferents efectes sobre el patògen al qual ataquen:
  • bactericida: provoquen la mort del bacteri, però no la lisi de la cèl·lula.
  • bacteriostàtic: no eliminen el bacteri, sinó que n'impedeixen el creixement. Un cop es deixi d'utilitzar, el desenvolupament del bacteri continuarà.
  • bacteriolític: provoquen la mort del bacteri per la lisi cel·lular.
Classifiquem segons el seu blanc d'acció en:

Figura 1. Blanc d'acció dels diferents tipus d'antibiòtics.
  • Antibiòtics que actuen en la síntesi de la paret cel·lular:Aquests antibiòtics són la cidoserina, la vancomicina, la bacitracina, les penicil·lines o beta-lactàmics, les cefalosporines...

Figura 2. Estructura d'un beta-lactàmic.
  • Antibiòtics que actuen en la sintesi de la membrana plasmàtica:Aquests antibiòtics són les polimixines.

Figura 3.Estructura d'una polimixina.
  • Antibiòtics que actuen en la replicació del DNA:Aquests antibiòtics són les quinolones.

Figura 4. Estructura de les quinolones
  • Antibiòtics que actuen sobre la RNA polimerasa:Aquests antibiòtics són la rifampicina.

Figura 5. Estructura d'una rifampicina.
  • Antibiòtics que actuen en la síntesi de les proteïnes que conformen els ribosomes:Aquests antibiòtics són l'eritromicina, cloranfenicol, dindamicina, lincomicina, tetracidina, espectinomicina, estreptomicina, gentamicina, kanamicina i nitrofurans.

Figura 6. Estructura d'una tetraciclina.
  • Antibiòtics que actuen en el metabolisme de l'àcid fòlic: Aquests antibiòtics són el trimetoprim i les sulfamides.

Figura 7. Estructura d'una sulfamida.

Vídeo 1. Mecanisme d'acció dels antibiòtics

Història dels antibiòtics

La primera referència que es té sobre l'existència dels antibiòtics prové de John Tyndal (1820-1893). Durant un procés experimental que duia a terme es va contaminar, amb Penicillium glaucum, un brou nutritiu que contenia bacteris, els quals van perdre la capacitat de desplaçar-se. J.Tyndal va arribar a la conclusió que el fong competia amb els bacteris per l’oxigen i, per això no va aprofundir més en l'estudi. No fou fins 1929 que Fleming va publicar oficialment el descobriment de la penicil·lina. Aquest descobriment es va esdevenir per un accident on se li va contaminar amb Penicillium notatum una placa de Petri que contenia Staphylococcus aureus. En comptes de llençar la placa contaminada, Fleming va observar una aureola al voltant del fong on no hi havia creixement bacterià. Així doncs, va ser com es va descobrir la penicil·lina.  L'etapa compresa entre 1940 i 1970 és considerada com el període d'or dels antibiòtics ja siguin naturals o sintètics .
Figura 8. A. Fleming, E. Chain y H. Florey


Vídeo 2. Descobriment dels antibiòtics

Producció d'antibiòtics


Els antibiòtics interaccionen amb la superfície de les cèl·lules bacterianes, ocasionant un canvi en la seva capaticat de reproduir-se. Diferents probes de laboratori ens indicaran quina quantitat d'antibiòtic és necessària per a produir algun efecte sobre els bacteris. La dosi d'antibiòtic necessària per matar o aturar el creixement d'un bacteri pot ser molt diferent segons el tipus i, una gran dosi pot tenir efectes negatius sobre les persones.Per això, els antibiòtics es subministren en petites quantitats. Si se'n pren una quantitat inferior a la recomanada, el bacteri pot desenvolupar resistències a aquest.

Actualment es fabriquen antibiòtics naturals i sintètics.



-Naturals:

Fins fa poc temps els antibiòtics es produïen per biosíntesi, és a dir, el procés pel qual s'obtenen antibiòtics a partir d'organismes vius.Actualment encara s'utilitza i que consisteix en subministrar als bacteris les condicions necessàries perquè es desenvolupin correctament.

-Sintètics:
Tots els tipus de penicilina poseeixen un nucli químic idèntic anomenat anell. La cadena química que està adjunta a l'anell és diferent en cada tipus. Cambiant les molècules de la cadena, els científics disenyen drogues amb efectes potencialment diferents sobre organismes diferents. Algunes d'aquestes drogues són útils per tractar infeccions, altres no ho són.

Els fabricants farmacèutics utilitzen imatges de l'estructura dels antibiòtics, que estan generades per ordinadors, per experimentar amb diferents conformacions. Els investigadors han desenvolupat antibiòtics amb vida mitja-llarga (el període d'eficàcia), que permet prendre la medicació un cop cada 24 hores i no  cada poques hores. Els antibiòtics més nous són també més efectius contra una gama més amplia d'infeccions.
 
-Procés d'escalat:
La transferencia d’un procés industrial des del laboratori fins un fermentador comercial es realitza en diverses etapes. El procés s'inicia en un matràs i, si és factible, es transfereix al fermentador del laboratori, un recipient a petita escala, generalment de vidre i amb una capacitat d‘1 a 10 litres. Els primers assajos d’escalat es realitzen en aquest fermentador on també és possible assajar variacions en el medi, la temperatura, el pH, etc., d’una manera ràpida i econòmica.

Quan els assajos en el fermentador de laboratori tenen un resultat satisfactori, el procés passa a la planta pilot, on es repeteix el procés en fermentadors amb capacitats de 300 a 3.000 litres. En aquest punt, les condicions s’aproximen més a les del fermentador comercial, encara que el cost econòmic no és un factor determinant. Per últim, el procés passa al fermentador comercial, que té una capacitat de 10.000 a 500.000 litres.Durant totes les etapes de l’escalat, l’aireació és una variable fonamental que està sotmesa a un control estricte. A mesura que el procés d’escalat avança des del matràs fins el fermentador comercial, a més de mantenir la temperatura, el pH i els nutrients a nivells adequats, la dinàmica de l’oxigen es mesura cuidadosament per determinar com afecta els diferents increments de volumen a la demanda d’oxigen de la fermentació. En els fermentadors es forma un caldo que es manté a una temperatura de 25ºC i en agitació durant més de 100 hores. A continuació, es retiren les soques del caldo de fermentació i s'extreu l'antibiòtic mitjançant diferents mètodes de separació, com la filtració o la precipitació. 

En microbiologia industrial, moltes vegades es seleccionen genèticament varietats microbianes amb un alt rendiment, amb l’objectiu d’incrementar la producció. Per aquesta raó, el comportament de la soca de producció pot ser molt diferent de la soca de tipus salvatge.

Figura 9. Fermentadors d'investigació i producció. a) bateria de petits fermentadors d'investigació. Els fermentadors són els recipients de vidre amb una tapa d'acer inoxidable i les ampolles de plàstic recullen el producte. b) gran bateria de fermentadors industrials a l'aire lliure utilitzats en la producció industrial.

Futur dels antibiòtics

El futur de l'estudi dels antibiòtics necessita  canvis. Aquests són deguts a la reducció en el descobriment d’antibiòtics i a la poca durada que aquests tenen al mercat. La recerca de nous antibiòtics segueix diferents vies:

-Buscar altres organismes productors d'antibiòtics:
Els antibiòtics naturals no tenen un origen exclusivament fúngic o bacterià: també es coneixen empíricament extractes de plantes i animals amb propietats interessants pel desenvolupament de noves substàncies antibiòtiques, emprades des de fa molt de temps en l'homeopatia. Una altra possibilitat són els ecosistemes marins, on la competència per l'espai bentònic és una veritable guerra química i, aquell que és capaç d'inhibir la competència, esdevé colonitzador. Es disposa doncs, d'un bon reservori de possibles antibiòtics que encara no han estat descoberts.

-Conèixer la genòmica bacteriana:
Conèixer la importància de cada gen és bàsic.. Els gens reguladors són menys importants, ja que malgrat que augmenten l'eficiència energètica de l'organisme no són imprescindibles per a les seves funcions, mentre que els gens relacionats amb la síntesi d'estructures són imprescindibles pel fet que aquestes són el blanc d’acció de molts antibiòtics. Coneixent la genètica dels bacteris també s'espera poder combatre la seva capacitat d'adaptació als antibiòtics (creació de resistències) limitant la seva mutabilitat, per exemple, atacant als seus mecanismes de reparació genètica. Així doncs, el fet de conèixer el funcionament d'un bacteri a nivell genètic pot permetre trobar o dissenyar compostos que afectin la viabilitat de les cèl·lules o la seva adaptabilitat.
 
-Noves estratègies d'inhibició:
 Per a combatre bacteris patògens tenim l'opció d'investigar el camp dels "depredadors de bacteris" dels quals se'n coneixen tant virus com bacteris.

·Bacteriòfags: També anomenats fags, són virus que utilitzen la maquinària biològica dels bacteris per a reproduir-se, desenvolupant-se dins aquesta i llisant-la un cop són madurs. Amb els coneixements actuals sobre el funcionament dels fags es poden trobar tècniques per a infectar els bacteris sense produir efectes en els humans.


Figura 10. Estructura d'un bacteriòfag.


·Bacteris depredadors:Són bacteris capaços d'alimentar-se d'altres bacteris, ja que són incapaços de sintetitzar certs aminoàcids. A més, les preses són específiques per a una espècie de depredador. Un exemple és el bacteri Micavibrio aeruginosavorus, capaç de depredar, entre d'altres, el bacteri patògen Pseudomonas aeruginosa. Un avantatge dels bacteris depredadors és que eviten les estructures defensives de les preses. Així doncs, aquests depredadors són útils allà on els antibiòtics fallen.

Figura 11. Mètode d'acció del bacteri  Micavibrio aeruginosavorus

Aquests mecanismes "antibacterians" podrien revolucionar l'ús dels antibiòtics ja que tenen alguns avantatges:

-Els bacteris no creen resistències quan són atacats per més d'una banda. Això vol dir que si es combinen tècniques es pot arribar a combatre l'aparició de resistències.

-Els "depredadors de bacteris" i fags els necessiten per a la seva supervivència i reproducció, per tant, quan troben una presa no només l'eliminen, sinó que el nombre d'agents antibacterians augmenta (en el cas dels fags, augmenta exponencialment)

Aquests avantatges són interessants, però alhora hi ha certs desavantatges, com és el cas de la lisi dels patògens, en la qual s'alliberen substàncies que poden ser tòxiques. També hi ha la possibilitat que aquests organismes s'adaptin a "parasitar-nos", desenvolupant una nova patogenicitat.
Esdevindrà el remei pitjor que la malaltia?

Conclusions 

El descbriment dels antibiòtics ha suposat un avenç molt important per a la societat, ja que ha esdevingut la solució a moltes malalties. No obstant, el seu desenvolupament i ús ha estat descompensat amb el seu coneixement, ja que una excessiva i descontrolada medicació ens ha portat als problemes actuals; major resistència dels bacteris davant els antibiòtics i una vida útil molt curta d'aquests. Per això és necessari aprofundir en la recerca de nous mètodes que permetin lluitar contra els bacteris patògens. Uns bons exemples són  l'ús de medicines homeopàtiques, l'investigació de la genòmica bacteriana, l'ús de fags i bacteris depredadors... Tot i que encara queda molt camí per recórrer, ja s'observen alguns mètodes que podrien suposar una gran revolució.

Referències

Dr. Pedro F. Mateos. (2013). Tema 15: Producción de antibióticos. Recuperat 6 de Març de 2013, des de http://darwin.usal.es/profesores/pfmg/sefin/MI/tema15MI.html
Javier de Lucas. (2013). Los antibióticos y en especial la penicilina. Recuperat el 8 de Març de 2013, des de http://platea.pntic.mec.es/~jdelucas/antibioticos.htm

Textoscientificos. (2005) Recuperat el 7 de Març de 2013, des de http://www.textoscientificos.com/antibioticos/obtencion

Carmen Sánchez de Ribas. (2006). ¿Antibióticos, ayer, hoy y mañana...? Recuperat el 9 de Març de 2013, des de http://www.quimicaviva.qb.fcen.uba.ar/v5n2/sanchez.htm

Lucía Senra Bao. (2010). Microorganismo como fuente de producción de antibióticos. Recuperat el 7 de Març de 2013, des de http://blogs.creamoselfuturo.com/bio-tecnologia/2010/05/24/microorganismo-como-fuente-de-produccion-de-antibioticos/

Por qué biotecnología. (2012). Cuaderno nº 51: Biotecnología y producción de antibióticos. Recuperat el 8 de Març del 2013, des de http://www.porquebiotecnologia.com.ar/index.php?action=cuaderno&opt=5&tipo=1&note=51

Michael t. Madigan; John M. Martinko; Paul V Dunlap; David P Clark (2009). Tema 25. Microbiología industrial. Miguel Martín-Romo, Brock: Biología de los microorganismos.(12a ed., p. 811-864). Madrid: Pearson educación.
Michael J. Pelczar, Jr.; E.C.S. Chan; (1993). Microbiology: Concepts and applications. (7ªed. )USA: Mc Graw Hill

Prescott H, Klein. Microbiología (5ª ed.) (Falta mirar l'any, edició i cuitat d'edició)

9 comentarios:

  1. En general considero que us heu desviat força del tema proposat. Heu presentat un treball excessivament llarg (us recordo que havia de ser d’unes 1000 paraules aproximadament), i poc centrat. Tota la informació que poseu sobre els antibiòtics, definició, tipus, mecanismes d’acció, descobriment... hauria d’estar molt resumit, ja que aquest no és el tema del vostre treball. Segurament podríeu fer una taula resum amb tota aquesta informació. A més, trobo a faltar les espècies productores de cada antibiòtic. Quan arribeu a l’apartat de la producció microbiana us limiteu a descriure mecanismes per detectar productors d’antibiòtics, però no parleu de la PRODUCCIÓ. Heu de centrar el treball, parlar de la producció d’antibiòtics a petita i gran escala.
    L’apartat sobre el futur dels antibiòtics és interessant, m’ha agradat, però també us caldrà reduir-lo per ajustar-vos a les indicacions d’espai que us vam donar.
    Pel que fa al format, hauríeu de revisar l’ortografia, ja que he detectat alguns (pocs) errors. Recordeu que heu de citar les figures al text, i també les referències. Els videos no es poden veure, reviseu-ho, i si considereu que aporten informació sobre la producció d’antibiòtics, mireu de resoldre-ho. La majoria de les figures no aporten informació, per exemple, la foto de les plaques de petri és molt maca, però no aporta res al treball. Us recomano que busqueu o que feu vosaltres mateixos figures més informatives que aportin i aclareixin informació donada al text. També us recomano que consulteu també llibres de microbiologia i articles científics, i que no us quedeu només amb el llistat de pàgines web que teniu a l’apartat de referències (algunes no gaire fiables). Crec que teniu força feina per fer encara, us animo a que reviseu el treball detalladament.

    ResponderEliminar
  2. Hola de nou, em faltava comentar-vos que us heu oblidat de l'apartat de conclusions, al final del treball.

    ResponderEliminar
  3. Bones
    que es podrien combinar els efectes dels antibiótics amb els dels bacteris depredadors per combatre millor certes malalties?

    Gabriel Carmona i Guillem Arboix

    ResponderEliminar
    Respuestas
    1. Bones,

      Una de les conclusions que ens ha permès obtenir el treball és que es poden combinar vàries tècniques, com els bacteris depredadors i els antibiòtics, per tal de fer front als bacteris patògens amb una major eficàcia. Això es deu al fet que si intentem combatre un bacteri de diferents formes i, al mateix temps, aquest és incapaç de dessenvolupar resistències. No obstant, cal tenir en compte que el bacteri depredador utilitzat no sigui del mateix grup que el bacteri patògen, ja que sinó l'antibiòtic també l'afectaria a ell.

      Eliminar
  4. Pregunta avaluable:

    Les drogues a base de penicilina sintètica,que no serveixen per tractar infeccions, perque són utils?

    Helena Taberner

    ResponderEliminar
    Respuestas
    1. Bones,

      Tal com s'explica al blog, s'estan dissenyant nous tipus de penicil·lines mitjançant tècniques amb ordinadors. Això permet obtenir diferents conformacions estructurals en les penicil·lines, la qual cosa permet superar les resistències desenvolupades pels bacteris. No obstant, també es poden dissenyar variants de penicil·lines que, tot i no tenir l'efecte d'un antibiòtic, els productes resultants del seu metabolisme actuen aliviant dolors en l'organisme. Per exemple és el cas de la penicilamina, un metabòlit de la penicil·lina que és efectiu per aliviar el dolor de l'artritis reumatoide.

      Eliminar
  5. Pregunta avaluable:

    Els bacteriofags o fags poden esdevindre nocius per el nostre organisme?

    Mercè Miró

    ResponderEliminar
    Respuestas
    1. Este comentario ha sido eliminado por el autor.

      Eliminar
    2. fent referencia al que heu explicat en el apartat del futur dels antibiotics

      Eliminar