jueves, 14 de marzo de 2013

Bases genéticas de la interacción de las bacterias Agrobacterium y Rhizobium con las plantas.



Bases genéticas de la interacción de las bacterias 
Agrobacterium y Rhizobium con las plantas.






Introducción:

Agrobacterium y Rhizobium  son alfa-proteobacterias gram negativas pertenecientes a la familia Rhizobiceae, capaz de transferir su ADN entre reinos vegetales diferentes. En el caso de Agrobacterium se trata de un patógeno para la planta mientras que Rhizobium vive en simbiosis con ella.

AGROBACTERIUM

Las dos especies más conocidas son Agrobacterium tumefaciens y Agrobacterium rhizogenes. La primera genera tumores por transformación en células vegetativas en la unión del tallo con la raíz, lo que se conoce como enfermedad de la agalla de la corona. En cambio la segunda los provoca únicamente en las raíces. La infección se produce mayoritariamente en dicotiledóneas, siendo las monocotiledóneas normalmente poco susceptibles.

La transferencia, integración y expresión de un segmento de DNA de la bacteria en la célula vegetal es la causante de la enfermedad. Este segmento recibe el nombre de DNA de transferencia (T-DNA) y se encuentra en el plásmido Ti (inductor de tumores) característico de la bacteria. En el caso de Rhizogenes se denomina Ri.

Figura 1. Agrobacterium tumefaciens

Este segmento del plásmido contiene los genes para la síntesis de auxina, citoquina y opina. Mientras que en el resto del plásmido se encuentran los genes de transmisibilidad, del catabolismo de las opinas y los genes Vir. Estos últimos, codifican los factores para la transferencia e integración del T-DNA dentro del genoma de la planta. 

Figura 2. Ejemplo de plásmido Ti de Agrobacterium.



El mecanismo de infección es el mismo para todas las bacterias del género Agrobacterium, y se divide en los siguientes pasos:

1.- Reconocimiento y adhesión

Para la colonización de la planta por la Agrobacterium se requiere la existencia de heridas en la planta. Esta se desplaza hacia el tejido siguiendo un gradiente de concentración de señales químicas establecidas por secreciones del tejido vegetal. Los sensores proteicos responsables de esta identificación son virA y virG. La proteína virA codifica para la quinasa. Esta fosforilará a virG desencadenándose la activación del resto de los genes vir.
En este momento la bacteria sintetiza microfibrillas de celulosa que le permiten anclarse al lugar de la herida.

2.- Generación del T-DNA

Una vez activados los genes Vir, las proteínas virD1 y virD2 se unen a los extremos del T-DNA dejando aislada una cadena simple de T-DNA la cual se puede transferir a la célula vegetal. La proteína virD2 formará un complejo de transferencia en el extremo 5’ que protegerá al DNA de la actividad nucleasa celular.

3.- Exportación del T-DNA

Se lleva a cabo la formación de un canal entre Agrobacterium y la célula vegetal, formado por proteínas codificadas por los genes virB. En  Agrobacterium tumefaciens este sistema presenta 11 proteínas codificadas por el operón virB, y al menos una proteína del operón virD (virD4). Este transportador es fundamental para los procesos de patogénesis ya que puede exportar factores de virulencia importantes. Este sistema tiene tres componentes principales que son:

  • ·         el operón virB/virD4 necesario para la transferencia del DNA.
  • ·         el sistema Trb necesario para la transferencia del plásmido y sistema Ti  
  • ·         el sistema AvhB: se emplea cuando los anteriores fallan.


En este proceso intervienen otros factores como el factor virB1, que permite disolver la membrana de peptidoglicano de la pared bacteriana.

4.- Importación nuclear del complejo T

En el interior de la célula vegetal el complejo T-virD2 se une a las proteínas virE2, virE3 y virF, las cuales se unen con las chaperonas. Estas últimas se encargan de mantener la conformación del complejo hasta su llegada al interior del núcleo.

 
Figura 3. Resumen ilustrado de los pasos seguidos por Agrobacterium en el proceso de infección de la planta.

Este proceso puede ser asistido por proteínas de la propia planta, denominadas VIP1 que interactúan con las virE2, pudiendo ser un factor de regulación en función de la concentración.

5.- Integración del T-DNA

En este proceso interviene el factor virD2, el cual regula la integración del T-DNA dentro del genoma de la planta, activando los factores para la recombinación y ligación. En este proceso actualmente se sugiere que participan las histonas H2A.

                                                   Video 1. Infección por Agrobacterium


RIZOBIUM

La planta induce la infección de esta bacteria para obtener el nitrógeno que la bacteria puede fijar, a cambio, esta se protege en la planta. El nitrógeno es uno de los nutrientes esenciales para el crecimiento de las plantas, estas lo absorben a través del suelo en forma de amoniaco, pero en muchas ocasiones este es limitado en suelos pobres. Y por tanto ha tenido una gran repercusión en diversos campos.

Las etapas de la infección son:

1. Reconocimiento entre ambos organismos y adherencia de la bacteria a los pelos radicales.

Las plantas, principalmente  leguminosas, tienen la capacidad de secretar compuestos específicos que atraen a los rizobios, como los flavonoides. en respuesta a ellos los rizobios activan una serie de genes implicados en la nodulación.

El primer paso en la formación de los nódulos es la adherencia de la bacteria a la planta. en esta intervienen sustancias como la proteína ricadesina, que actúa uniéndose al calcio en la superficie de los pelos radicales o las lectinas que se acoplan a un polisacárido de la superficie de la célula de Rhizobium.

2. Invasión del pelo radical y formación de un canal (o hilo) de infección:

Los pelos radicales se enroscan debido a la acción de sustancias específicas secretadas por la bacteria, conocidas como factores Nod. La bacteria penetra en el pelo radical e induce la formación, por parte de la planta, de un tubo de composición similar a la pared celular, conocido como canal de infección, que avanza por el pelo radical.



                                       figura 4: Rizhobium adentrándose en la raíz por el pelo radical

3. Desplazamiento de las bacterias por las raíces a través del canal de infección y posterior transformación en bacteroides

La bacteria entra en el pelo y forma canales, recubiertos por nuevo material de pared celular, que van ramificándose. Estos canales de infección van entrando en la raíz al mismo tiempo que las células corticales de esta comienzan a dividirse para formar el primordio de nódulo. El canal de infección se dirige hacia este primordio del nódulo en formación. En los canales se dividen varias veces y se transforman en bacteroides, formaciones ramificadas, hinchadas y deformes,  que quedan rodeadas por una membrana bacteriana denominada peribacteroida; formando los simbiosomas. La fijación del nitrógeno no se inicia hasta que no se han formado los bacteroides.



Conclusión:

Tanto Agrobacterium como Rhizobium son bacterias Gram-negativas que infectan plantas y generan un crecimiento anormal en ellas. En el caso de Rhizobium, la bacteria vive en simbiosis con la planta, mientras que Agrobacterium resulta patógena para esta.


Agrobacterium causa tumores en plantas para la producción de sustancias que por ellas mismas no pueden sintetizar. Lo genes oncogénicos del plásmido Ti codifican enzimas para la producción del tumor y la síntesis de opinas. La bacteria necesita las opinas como fuente de carbono y nitrógeno. Por otra parte, los genes oncogénicos del plásmido Ri provocan en la planta un incremento en la síntesis de auxina. Este aumento lleva consigo una sobreproducción del tejido radical, que a su vez codifica para la síntesis de opina. El conocimiento de los mecanismos por los que actúa la Agrobacterium ha permitido la creación de infinitud de plantas transgénicas a partir de la adición de fragmentos de ADN foráneo.

En el caso de Rhizobium, su simbiosis con la planta y la formación de nódulos en sus raíces supone un aumento significativo del nitrógeno en suelos pobres, permitiendo el crecimiento de otras especies que bajo dichas condiciones no podrían. Por otro lado, contribuye a la disminución del uso de fertilizantes nitrogenados, causantes de gran parte del deterioro ambiental. Los fertilizantes causan eutrofización de aguas, erosión de suelos y lluvias ácidas. Debido a esto, podemos considerar Rhizobium como un fertilizante biológico, siendo capaz de mejorar la producción agrícola de forma natural.


Referencias



  • Madigan, Michael T., et al. “Ciclos de los nutrientes, biorremediación y simbiosis” Brock biología de los microrganismos. 12º ed Madrid: Pearson Educación, 2009. 801-802.
  • Nabors, Murray W. “Biotecnología Vegetal” Introducción a la botánica. 1ª ed Madrid: Pearson Educación, 2006. 341-343.

4 comentarios:

  1. El contingut és correcte, però només s'hi explica un dels dos tipus de bacteris que s'haurien de tractar, ja que el tema inclou tant Agrobacterium com Rhizobium. Cal, doncs, que l'amplieu per poder explicar també les interaccions que produeix Rhizobium amb les plantes. A més, com que són bacteris que porten a terme processos similars (encara que amb diferents finalitats), la inclusió d'aquest altre cas us permetrà fer comparacions entre ambdós casos. Evidentment, això no serà possible si no reduïu bona part del text, i per tant haureu de fer un esforç de síntesi per explicar el cas d'Agrobacterium de forma més breu. De fet, el nivell d'aprofundiment a què arribeu en l'explicació de les diferents fases de la infecció per Agrobacterium no és necessari, i fins i tot dificulta la comprensió del procés, de manera que el treball també hi sortirà guanyant si feu una simplificació amb un enfoc més didàctic (no es tracta tant d'explicar moltes coses, a un nivell molt complex, sinó d'intentar que el que s'explica sigui fàcilment comprensible). Ja feu una bona utilització dels recursos que us ofereix internet, de manera que en aquest sentit està bé que mantingueu aquest mateix estil.
    Hauríeu de millorar una mica l'estructuració, especialment al principi: fins que no arribeu a la presentació de les diferents fases de la infecció, l'estructura dels apartats és confusa, tot i que el fil conductor que segueix l'explicació és molt correcte, de manera que per exemple no se sap on acaba la introducció i comença el primer apartat de desenvolupament del tema.
    També hauríeu de revisar la manera d'escriure els noms de les espècies i gèneres, ja que hi teniu alguns errors.
    Finalment, recordeu-vos de citar correctament totes les figures, taules i referències en el text, així com d'introduir els noms dels components del grup.

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  2. Este comentario ha sido eliminado por el autor.

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  3. Pregunta evaluable:

    Al principio mencionáis que tanto Agrobacterium como Rhizobium son microorganismos que transfieren su ADN a células vegetales, pero en el caso de Rhizobium, ¿lo integra en algún momento o no le es necesario?

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    1. La Rhizobium no transfiere parte de su DNA al genoma de la planta, sino que al entrar en contacto con ella activa los genes para la nodulación.

      Gracias por leer nuestro blog.

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