miércoles, 13 de marzo de 2013

La recerca de nous antibiòtics en el medi marí


La recerca de nous antibiòtics en el medi marí
Som la Carlota Aguilera, Marta Batista, Laia Busquets  i Gemma Bustins, estem cursant segon de Biologia a la Universitat de Girona i realitzem aquest blog per a l’assignatura de Microbiologia. Esperem que després de llegir la nostra publicació entengueu la importància de cercar nous antibiòtics en el medi marí.


1. Què és un antibiòtic?

Els antibiòtics són substàncies químiques capaces d’inhibir el creixement d’altres microorganismes o d’eliminar-los a baixes concentracions. Provoquen alteracions a la paret cel·lular, membrana plasmàtica, síntesi de proteïnes i al metabolisme d’àcids nucleics (Brock, 1978). La majoria d’antibiòtics són produïts per bacteris i fongs.

Hi ha antibiòtics de baixa toxicitat, com la penicil·lina, i d’alta toxicitat que, a diferència dels altres, no acostumen a utilitzar-se ja que podrien provocar alteracions a la microbiota corporal. D’altra banda, els antibiòtics també es distingeixen segons el comportament d’aquests sobre el microorganisme: són bactericides quan causen la mort del bacteri i bacteriostàtics si només inhibeixen la seva replicació.

Durant la II Guerra Mundial es va produir una gran demanda d’agents quimioterapèutics per a tractar les infeccions produïdes per ferides, al llarg dels anys l’ús i abús dels antibiòtics ha generat una resistència dels microorganismes (Pedro F. Mateos).

Per aquest motiu, el nombre d’antibiòtics eficaços s’ha reduït dràsticament, i es preveu que al llarg del temps aquesta eficàcia es redueixi encara més; és per això que s’estan investigant noves fonts d’extracció per a produir nous antibiòtics pels quals els bacteris no siguin resistents i, el medi marí (fig. 1) és una d’aquestes fonts.


Fig 1Nova font de recerca, fons marí en el que s’hi observa una gran diversitat d’éssers vius. http://blocs.xtec.cat/escagustibartra/page/7/

Els bacteris presenten molta facilitat per adquirir resistència, ja que poden intercanviar material genètic fàcilment entre individus a través dels processos de conjugació, transformació i transducció. Els principals mecanismes de resistència als antibiòtics (fig. 2) es poden agrupar de la següent manera (Enrique Iáñez, 2008):

­          -Disminució de la permeabilitat cap a un antibiòtic:
La resistència ve donada per la membrana externa en Gram negatius, alteracions de la càpsula, mecanismes d'extrusió activa de l'antibiòtic o per alteració del mecanisme de transport de l'antibiòtic.

­         - Inactivació enzimàtica de l'antibiòtic:
Aquest mecanisme depèn en molts casos dels plasmidis resistents que poden ser transmesos entre bacteris.  

­        -  Modificació química de la diana sobre la qual actua l'antibiòtic:
En la majoria dels casos han esdevingut resistents a causa de mutacions cromosòmiques o canvis conformacionals a l’ARN.

­         - Síntesi d'un enzim resistent:
Determinats plasmidis R contenen gens de resistència a sulfamides, trimetoprin i  meticil·lina.


Fig 2Antibiograma, tècnica per a verificar la resistència o no a antibiòtics. Les zones on l’antibiòtic és eficaç són aquelles on es forma un halo d’inhibició, és a dir absència de microorganisme. D’altra banda, les zones en que el microorganisme és resistent a l’antibiòtic s’observa una absència d’halo.            http://www.apcontinuada.com/es/el-antibioigrama-interpretacion-del-antibiograma/articulo/80000504/

2. Noves propostes: antibiòtics d’origen marí.

Molts organismes marins són actualment considerats fonts molt riques en substàncies bioactives. Per aquest motiu la recerca en el camp dels antibiòtics marins està augmentant.

Els primers estudis sobre bacteris marins productors d’antibiòtics van ser realitzats per Rosenfeld Zobell (1947). A partir d’aquest moment, la recerca i aïllament de bacteris amb activitat antagònica sobre microorganismes patògens marins i terrestres, ha estat realitzada en diversos hàbitats i organismes com en l’aigua de mar, sediments, fitoplàncton, vertebrats i invertebrats.

A causa de la disminució en l'eficàcia dels antibiòtics actuals, enguany s’ha creat el projecte PharmaSea on hi participaran diversos països de tot el món, amb l’objectiu de cercar nous antibiòtics a partir dels sediments i el fang del fons marí  de tot el món (PharmaSea, 2013).

A continuació s’exposen alguns casos:

En relació als microorganismes, recents troballes mostren l’existència de soques natives que contenen un gran nombre de metabòlits interessants per la producció d’antibiòtics. Fa poc, a la costa de Mèxic s’ha trobat Pseudoalteromonas sp,. un microorganisme que produeix molècules que poden combatre Staphylococcus aureus (MRS) Pseudomonas aeruginosa, els quals presenten resistència als antibiòtics tradicionals. A més a més, també presenta propietats anticancerígenes (Informador, 2013).

L’estudi realitzat per Jorge León et al. l’any 2010, demostra que les soques bacterianes existents en l’estrella de mar, Heliaster helianthus (fig. 3), presenten activitat inhibitòria enfront patògens humans



Fig 3. Espècie: Heliaster helianthus, utilitzada en l’estudi de Jorge León. http://www.flickr.com/photos/agrojocho/4639398891/

L’estudi es va realitzar amb diverses soques bacterianes, de les quals es van seleccionar les que  presentaven la capacitat d’inhibir, com a mínim, una de les tres soques control Gram positives. La taula 1 mostra els resultats d’aquest primer anàlisi.

Taula 1. Tamís antibacterià de soques marines aïllades d'invertebrats intermareals, recol·lectats a la “Bahía de Ancon” (Perú).

Tamís indicador
Soca
Font
S. aureus
B. subtilis
M. luteus
 An-10
 Anèmona
++
+++
++
An-13
Anèmona
+
+++
+
E-12
Eriçó
+++
++
+
E-20
Eriçó
+++
+++
++
EM-2
Estrella de mar
+++
++
+
EM-5
Estrella de mar
+
++
+
EM-10
Estrella de mar
+++
+++
++
EM-14
Estrella de mar
+++
++
+
PS-4
Peje gripau
-
++
+
C-2
Cargol
+++
+++
-
L'activitat antimicrobiana s'expressa com el diàmetre de l'halo inhibitori (mm) al voltant d'una macrocolònia: +: 3-7mm, ++: >7-20mm, +++: >20mm, -: sense inhibició.

A continuació, es van dur a terme les proves d’antibiosis a les 10 soques seleccionades enfront potencials patògens humans. A la taula 2 es representen els resultats de l’anàlisi.

Taula 2. Bacteris marins aïllats d'invertebrats intermareals de la “Bahía de Ancón” (Perú) i la seva activitat antimicrobiana contra potencials patògens humans.

Patògens potencials
Soca
SA
M
VC
VP
ST
AH
PA
YE
EC
An-10
+
+
+
-
-
++
-
-
+
An-13
++
++
++
+
+
-
-
-
-
E-12
++
+
-
++
-
+
+
-
++
E-20
++
++
-
+
-
-
-
-
-
EM-2
++
-
-
-
+
+
-
+
+
EM-5
+
-
-
-
-
+
-
-
-
EM-10
+++
++
++
++
+
+
++
-
+
EM-14
++
-
+
-
-
-
-
-
-
PS-4
++
-
-
+
+
++
-
+
-
C-2
++
-
-
-
+
-
-
-
-

SA: Staphylococcus aureus; M: Micrococcus sp.; VC: Vibrio cholerae; PV: Vibrio parahemolyticus; ST: Salmonella tihpy; AH:Aeromonas hydrophila; PA: Pseudomonas aeruginosa; YE: Yersinia enterocolitica; EC: Escherichia coli.
Diàmetre de l’halo d'inhibició (mm): +: 3-7; ++: >7-20; +++: >20; -: sense inhibició

Un estudi molt similar, descriu l’aïllament i el potencial inhibidor de soques bacterianes natives associades als mol·luscs bivalves: la “petxina de ventall”, Agropecten purpuratus i la “ostra”, Crassostrea gigas en sistemes de cultiu. Els resultats suggereixen que els bacteris aïllats podrien ser aprofitats com agents antibiòtics en el control biològic de patògens d’organismes marins d’interès en maricultura. (F. Pellon et al., 2001).

A continuació es presenta un vídeo on podem observar com s’utilitzen les substàncies segregades per esponges i altres animals fixats al substrat. (Quèquicom, 2009).




3. Actualment.

A partir de mostres d'organismes marins, empreses de recerca com PharmaMar duen a terme l'extracció i aïllament de les molècules d'interès mitjançant tècniques cromatogràfiques i la identificació de la seva estructura química (Fig 4.). Les molècules amb activitat antitumoral i innovadora són dissenyades i sintetitzades al laboratori mitjançant un procés químic. La síntesi química evita recórrer a la font natural ja que permet l'obtenció dels compostos en quantitats suficients per al seu desenvolupament i futura comercialització. (PharmaMar, 2013).  



Fig 4. Procediment utilitzat per PharmaMar en l’extracció de molècules amb activitat antitumoral. 1- Expedicions i presa de mostres del fons marí, 2- Identificació de les mostres, 3- Diferenciació entre microorganismes i macroorganismes, 4 i 5- Avaluació de l’activitat tumoral, 6- Purificació i aïllament de les substàncies antitumorals, 7- Síntesi química dels compostos, 8- Obtenció de compostos anàlegs, 9 i 10- Avaluació en animals, 11- Patentar, 12- Procés de producció industrial, 13- Producció dels principis actius, 14- Provar el fàrmac en pacients i si els resultats són satisfactoris comercialitzar el producte. (PharmaMar, 2013).

A continuació a la figura 5 es mostren cinc compostos que es troben en via de desenvolupament clínic. 


Fig 5. Representació de cinc fàrmacs d’origen marí que es troben actualment en vies de desenvolupament. Yondelis® és el fàrmac més avançat ja que es troba al mercat per algunes de les seves propietats, tot i això encara s’estan estudiant algunes de les seves propietats. (PharmaMar, 2013).

Avui en dia, un dels compostos comercialitzats és Yondelis® (trabectedina) és un agent antitumoral d’origen marí descobert en el tunicat colonial Ecteinascidia turbinata (fig. 6). Actualment es produeix per síntesi química.        
 

A més a més s’estan duen a terme assajos de fase II amb Yondelis® per a càncer de mama i tumors pediàtrics, i de fase III per a sarcoma de teixits tous
.


Fig 6. Espècie: Ecteinascidia turbinata, utilitzada per a produir el fàrmac Yondelis®.


5. Conclusions. 

Hi ha nombrosos organismes marins que tenen substàncies capaces de combatre diverses malalties perjudicials per a l’home i altres éssers vius. Per tant , la ciència encara té molt de camp per recórrer en aquest àmbit.

Tot i que els resultats són esperançadors, és gairebé impossible trobar un fàrmac extret del mar que sigui eficaç per a diverses malalties, a més a més la recerca de nous antibiòtics i fàrmacs és un procés complicat degut a la gran diversitat de molècules que formen els organismes marins.

Per això és important conscienciar-se de que no s’ha d’abusar dels antibiòtics, ja que les fonts d’on s’extreuen són limitades i a la llarga és probable que s’esgotin els recursos per a combatre alguns microorganismes patògens.

6.Bibliografia

Llibres:
  • Austin, B. Marine Microbiology. 1a ed. New York: Cambridge, 1988.
  • D. Brock, T. Biología de los microorganismos. 2a ed. Barcelona: Omega, 1978.
  • Dopazo CP et al. Inhibitory activity of actibiotic producing marine bacteria against fish pathogens. 1a ed. J Appl Bacteriol, 1988.
  • Pumarola, A, et al. Microbiologia y parasitologia medica. 1a ed. Barcelona: Salvat, 1984.
  • Westerdahl A, Olsson J, Kjelleberg S, Conway P. Isolation and characterization of turbot (Scophtalmus maximus) associated bacteria with inhibitory effects against Vibrio anguillarum. Appl Environ Microbiol. 1991; 57(8): 2223-28.

Pàgines web:
Articles de revistes electròniques:

22 comentarios:

  1. El treball em sembla correcte, m’ha agradat força, el tema està ben centrat i és interessant. L’extensió és superior a la que us vam demanar, unes 1000 paraules. Hauríeu de mirar de sintetitzar una mica el treball.
    Introducció. Crec que aquest apartat l’heu de refer una mica, i fins i tot, potser fer-ne un de sol dels tres primers. Es tracta que a la introducció plantegeu el problema: Què són els antibiòtics (resumit), quina problemàtica hi ha (resistències, aquest apartat ja m’agrada força), i quina és la solució que es planteja (recerca de nous productes del medi marí) i perquè .
    Antibiòtics d’origen marí. Aquest apartat m’agrada bastant, i veig que heu buscat força informació. Tot i així crec que hauríeu de començar amb un text més general i després comentar els exemples. Quina és l’aproximació a seguir quan busquem aquests antibiòtics en medi marí? En general quins passos cal seguir? Els exemples els podeu resumir una mica per no tenir problemes d’extensió. La referència (Informador, 2013) no l’he trobat al llistat final. Tot el procés seguit per León et al (2010), és una mica massa llarg, massa detallat, i crec que el podeu resumir molt. També seria interessant saber en quin estat està aquesta cerca. Hi ha algun antibiòtic comercialitzat que s’hagi obtingut del medi marí? N’hi ha que estiguin en fase d’estudi?? Què en sabeu?
    Les conclusions són correctes, però potser una mica massa informals. Quines són les implicacions d’aquesta cerca a nivell econòmic i social? Quan creieu que tindrem resultats del projecte PharmaSea? I quina és la importància d’aquest projecte?
    Format. Els peus de figura són bastant incomplerts, haurien de ser més detallats, i incloure la font d’on heu tret les imatges. Les referències estan ben citades i el llistat final és correcte, a més us felicito per haver buscat també articles científics i llibres.

    ResponderEliminar
  2. Més que antibiòtics sembla que es tracta de substàncies antitumorals. En el video del quéquicom semblava que encara no s'havia comercialitzat cap medicament en canvi, comenteu que ara ha sortit el Yondelis per tractar certs tumors. Sabrieu dir per a quins tumors es fa servir aquest compost? Parleu de l'empresa PharmaMar i doneu a entendre que hi ha altres empreses que segueixen el mateix camí. Jo no havia sentit a parlar mai d'aquestes investigacions, realment hi ha moltes empreses que estan obrint les portes a buscar medicaments d'origen marí?
    Crec que és un tema molt i molt interessant, m'ha agradat molt conèixer'l una mica més.
    MARIA CALDERÓ PASCUAL

    ResponderEliminar
    Respuestas
    1. Tal i com s'observa a la imatge número 5, Yondelis és un medicament que es comercialitza i tracta el càncer d'ovari i sarcoma de teixits tous. Tot i això, encara s'estan investigant més propietats d'aquest fàrmac, però les dos propietats citades anteriorment es troben al mercat.

      Actualment el nombre d'antibiòtics eficaços està disminuint degut a la resistència dels patògens, és per això que moltes farmacèutiques busquen en nous medis per trobar nous fàrmacs efectius. Per tant, podem dir que hi ha moltes empreses que estan iniciant aquesta nova recerca, aquestes encara es troben en les fases inicials i per això la recerca en el medi marí no és gaire coneguda.

      Esperem haver-te respost els dubtes.

      Eliminar
  3. Este comentario ha sido eliminado por el autor.

    ResponderEliminar
  4. Bones!
    Tinc un petit dubte: heu comentat que bàsicament s’obtenen aquestes molècules d’interès clínic per aïllament o directament per síntesi química. Però també heu esmentat el cas dels bacteris marins Pseudoalteromonas, que semblaria tenir un elevat interès pel fet de poder fer antibiòtics contra microorganismes patògens comuns com són S. aureus i P. aeruginosa. Llavors, i tot i que la informació és recent, sabeu si s’ha aconseguit cultivar aquest o altres bacteris marins en placa per poder obtenir i aïllar més fàcilment aquests metabòlits que actuarien com antibiòtics?

    Moltes gràcies!

    Gerard Funosas

    ResponderEliminar
    Respuestas
    1. (Comentari avaluable).
      Per cert, no puc posar els noms dels bacteris en cursiva.

      Eliminar
    2. Inicialment, per a cultivar un microorganisme i aïllar-ne els seus metabòlits ho hem de fer en placa, quan s'ha aconseguit aïllar-lo i identificar-lo correctament podem sintetitzar-lo químicament al laboratori per així no haver de recórrer a la font natural. Tot i això, es fa molt difícil cultivar en placa els microorganismes que viuen en el medi marí, es per això que el nombre d'antibiòtics procedents d'aquest medi es poc nombrós. Segurament al medi marí i altres ambients hi ha molts microorganismes que no coneixem degut a que nosaltres encara no els sabem cultivar al laboratori, quan avancin aquestes tècniques el nombre d'antibiòtics augmentarà.

      Eliminar
  5. Avaluable:

    M'agradaria saber si aquests antibiòtics marins s'apliquen en els humans en l'actualitat? i si causen riscos en la salut humana? i si s'està investigant la reserca d'antibiòtics marins en el mar mediterrani?

    Moltes gràcies!

    Cristina Toda Morelló (GM3)

    ResponderEliminar
    Respuestas
    1. Sí que s'apliquen antibiòtics marins a humans en l'actualitat, un clar exemple es Yondelis.

      Abans de la seva comercialització es realitzen assajos per a comprovar que no causen efectes greus a la salut, tot i això, els antibiòtics poden causar efectes secundaris i afectar a la microbiota corporal, es per això que s'han d'utilitzar sota preinscripció mèdica.

      La recerca d'aquests antibiòtics es realitza en diferents mars degut a que cascun presenta unes propietats tant físiques com químiques diferents.

      Eliminar
  6. (Avaluable):

    A la llarga, els patogens comuns no podran també esdevenir resistents a aquests antibiòtics produits a partir de metabòlits d'organismes marins? Quins són aquests metabólits i què els fa diferents als que ja coneixem actualment i formen part dels antibiotics més comuns?

    Moltes gràcies, he trobat molt interessant el vostre treball!

    Eva Irene Ibars Estiarte

    ResponderEliminar
    Respuestas
    1. Molt probablement els patògens comuns adquireixen resistència al cap del temps, la manera d'evitar això és utilitzar els antibiòtics correctament i no fer-ne un mal ús.

      Els patògens actuals han desenvolupat resistència a alguns antibiòtics que hi ha actualment al mercat, per tant, els nous antibiòtics que es comercialitzen tenen unes propietats diferents, per les quals els microorganismes no han adquirit cap resistència.

      És molt difícil saber exactament quins metabòlits actuen enfront el patogen, ja que depen de l'organisme del qual s'ha extret l'antibiòtic. Per a saber-ho es podria realitzar un anàlisi químic del metabòlit d'interès.

      Eliminar
  7. Pregunta avaluable:

    Bones,

    He estat llegint els diferents exemples d'obtenció d'antibiòtics a partir d'organismes marins. M'ha cridat l'atenció (Taula 1 i Taula 2) el grup tan concret d'organismes que heu escollit: la majoria són equinoderms. És possible que hi hagi un origen comú entre els diferents antibiòtics ?

    A part, aquests antibiòtics quin tipus de molècules són o quins efectes tenen? Amb això podríem veure o en part contestar la meva anterior pregunta.

    I ja per acabar, aquests antibiòtics que fabriquen tenen una utilitat per ells ? És a dir, alguns d'aquests microorganismes també els infecten ? Perquè si no és així seria molt curiós.

    Moltes gràcies,

    Jordi Galiano Landeira.

    ResponderEliminar
    Respuestas
    1. Les substàncies que s'extreuen dels individus marins de la taula 1 i 2 i que s'aprofiten per a realitzar antibiòtics, normalment les produeixen com a mecanisme de defensa dels seus depredadors o per a completar el seu metabolisme. A més a més, els individus dels quals se n'extreu l'antibiòtic tenen una relació simbiòtica amb els microorganismes que conviuen amb ells, els quals sintetitzen els metabòlits.

      Els individus d'un mateix fílum, que han evolucionat des d'un mateix ancestre comú presenten simbiosi amb microorganismes comuns, ja que aquests són necessaris per a la seva supervivència. D'altra banda, podria ser que la majoria d'individus utilitzats siguin equinoderms degut a que encara no s'han trobat tècniques per extreure nous antibiòtics d'altres organismes.

      Eliminar
  8. Pregunta avaluable:

    Creieu que no hi ha hagut prou recerca en el fons marí per manca de pressupost o eines necessàries per explorar-lo? O simplement perquè és un món més desconegut? O bé penseu que ara comença aquesta recerca a causa de que s'estan esgotant altres recursos?

    Realment, encara que sigui complex d'estudiar, amb la gran diversitat de microorganisme que es podrien trobar en el fons marí, segur que es podrien arribar a investigar un munt de coses!

    Molt interessant:)


    Marina Castro Rodà

    ResponderEliminar
    Respuestas
    1. La recerca d'antibiòtics en el medi marí està adquirint més ressò durant aquests últims anys degut a que els antibiòtics actuals estan perdent la seva efectivitat. A més a més, les tècniques actuals permeten cercar en medis fins ara desconeguts on anteriorment era gairebé impossible extreure'n substàncies d'interès comercial.

      L'avenç d'aquestes tècniques ha abaratit els costos de la recerca en medis de difícil accés, tot i que segueix sent bastant costós investigar en aquests medis.

      Eliminar
  9. Avaluable:

    Heu comentat que les molècules amb activitat antitumoral i innovadora poden ser dissenyades i sintetitzades al laboratori mitjançant un procés químic. No creieu que s'hauria d'investigar molt més això que no pas recórrer a la font natural, al fons del mar? I aquests organismes marins, obtenen beneficis o desaventages alhora d'adquirir aquest tipus de bacteris?

    Un tema molt interessant!

    Gràcies

    Alex Fernández Baena

    ResponderEliminar
    Respuestas
    1. Per a poder sintetitzar molècules o metabòlits químicament al laboratori primer cal disposar d'una molècula original que s'ha d'extreure del medi natural. Evidentment, a la llarga és d'una gran importància sintetitzar les molècules al laboratori per tal de no sobre explotar el medi d'on s'extreu la molècula inicial i abaratir els costos de l'estudi.

      Si que es poden dissenyar noves molècules al laboratori però tenint en compte la diversitat de molècules possibles i l'efecte específic que volem que tinguin es necessita d'un procés molt llarg i costos.

      Els organismes marins que conviuen amb bacteris n'obtenen beneficis perquè es tracta d'una relació simbiòtica, aquests secreten toxines per a defensar-se i completar el seu metabolisme. Tot i això, alguns poden ser patògens.

      Eliminar
  10. (Avaluable)

    Comenteu que actualment hi ha una disminució de l'efecte dela antibiòtics. Hi hauria la possibilitat de remediar-se amb antibiòtics marins?

    Moltes gràcies! Súper interessant!M'ha agradat molt


    Gemma Miró Escoda (Biologia)

    ResponderEliminar
    Respuestas
    1. És cert que l'efecte dels antibiòtics actuals ha disminuït, per això s'està intentant buscar en nous medis per a solucionar aquesta mancança.

      Tot i això si no s'utilitzen els antibiòtics correctament el problema no desapareixerà.

      Eliminar
  11. Avaluable

    Hola! M'ha semblat un tema molt interessant. Voldria preguntar si coneixeu fins a quin punt agents antitumorals trobats al fons marí, com per exemple Yondelis, són específics pel tractament de tumors malignes, i per tant, si s'ha comprovat que el seu mecanisme d'acció sigui únic a nivel genètic per tal d'evitar divisions cel·lulars excessives.

    Moltes gràcies,

    Naima González Fakir

    ResponderEliminar
    Respuestas
    1. Els antibiòtics abans de ser comercialitzats han de passar per un procés de validació que comprova la coherència entre les propietats que el comerciant diu que té i les que realment presenta.

      Tal i com s'observa en el vídeo del Quèquicom les indústries farmacèutiques proven els nous fàrmacs en diferents cèl·lules tumorals, com per exemple de l'úter. Gràcies als diferents cultius es poden descartar els tipus de cèl·lules sobre les quals el fàrmac actuarà beneficiosament. No es descarten efectes secundaris del fàrmac. S'han de realitzar estudis posteriors, per tal de determinar el mecanisme amb el qual s'eviten les divisions cel·lulars excessives.

      Eliminar