jueves, 14 de marzo de 2013

Adaptacions dels procariotes a temperatures extremes

Adaptacions dels procariotes a temperatures extremes
Introducció
A la Terra podem trobar multitud d’hàbitats que es diferencien, entre ells, per factors com la temperatura,  el pH, la salinitat, etc. Segons quins d’aquests paràmetres considerem, trobarem uns organismes o uns altres adaptats a aquestes condicions. A temperatures extremes, els organismes, moren immediatament o són incapaços de reproduir-se. Però fa uns seixanta anys, es va descobrir que certs microorganismes procariotes van desenvolupar certes adaptacions per poder viure en ambients amb aquestes temperatures. En canvi, no es coneix cap eucariota capaç de sobreviure en aquestes condicions.
El metabolisme dels procariotes pot ser molt diferent entre ells. Per aquest motiu són un grup molt divers, i els podem trobar en un ampli rang de temperatura. Podem distingir quatre grups principals de microorganismes segons en rang de temperatura en el qual els trobem:

Temperatura
Hipertermòfils
80-113ºC
Termòfils
Per sobre dels 45ºC
Mesòfils
15-35ºC
Psicròfils
5-15ºC

Taula1: Classificació dels procariotes segons les seves temperatures òptimes de creixement.
Els psicròfils es troben als oceans, a les profunditats marines, en àrees permanentment congelades de l’Àrtic i l’Antàrtic. Per altra banda, els hipertermòfils i termòfils es localitzen en fonts termals i/o ambients d’aigües calentes. Tot i així, actualment, es poden trobar microorganismes termòfils en fonts tèrmiques artificials, així com escalfadors d’aigua. Els organismes més termòfils són espècies d’arqueus. 

Estratègies d’adaptació dels procariotes a les temperatures extremes
Estabilitat de la molècula
Perquè un organisme pugui crèixer en altes temperatures, especialment tan altes com les dels hipertermòfils (>80ºC  ), tots els components cel·lulars, ja sigui proteïnes, àcids nucleics o lípids, han de ser estables a la calor. Algunes característiques no covalents pertanyen a les proteïnes termoestables:
-Relació superfície-volum baixa, que confereix una forma compacta de la proteïna.
-Reducció en el contingut de glicina que tendeix a eliminar les opcions de flexibilitat, i, per tant, introduir rigidesa a la molècula.
-Enllaç iònic extens a través de la superfície de la proteïna, que ajuda a compactar i resistir el desplegament a altes temperatures.
A més d’aquests factors d’estabilitat intrínseca, hi ha unes proteïnes especials anomenades “Chaperonines”, sintetitzades per hipertermòfils. Aquestes, uneixen proteïnes desnaturalitzades amb calor i dobleguen la molècula en la seva forma activa.
La girasa inversa té un paper important en l’estabilitat del DNA
Nivells alts de G i C  s'associen amb una major estabilitat termodinàmica de les molècules d'ARNm a la temperatura de creixement, això és degut  a que aquestes bases nitrogenades estan unides per tres ponts d’hidrogen.
Els hipertermòfils contenen proteïnes d’unió a DNA que tenen la funció de mantenir la doble cadena de DNA en altes temperatures.
Estabilitat de la membrana
La calor pot afectar a l’estabilitat de la membrana. Com ja sabem, les membranes cel·lulars estan formades per una bicapa lipídica. Si apliquem suficient calor, aquesta membrana es separarà, danyant la membrana citoplasmàtica i donant lloc a fuites. Per evitar que això passi a temperatures extremes, els psicròfils tenen membranes amb lípids rics en àcids grassos poliinsaturats. Aquests, mantenen les membranes funcionals i en estat semifluid a baixes temperatures. Al contrari que els termòfils, que presenten lípids rics en àcids grassos saturats que formen un ambient més hidrofòbic, afavorint l’estabilitat de la membrana. Els hipertermòfils han desenvolupat una estructura de membrana nova. No presenten àcids grassos en la seva membrana, sinó hidrocarburs que  s’adhereixen químicament als residus hidròfobs (gràcies a un enllaç éter al glicerol fosfat). Formen una monocapa lipídica, i eviten el trencament de la membrana a altes temperatures. La monocapa lipídica pot variar lleugerament entre espècies, però és una resposta evolutiva a la vida en altes temperatures.

Exemples i aplicacions
Hipertermòfils
Un exemple d’arqueu és el Pyrococcus furiosos. Aquest organisme habita en  aigües termals. El seu rang òptim de temperatura es troba al voltant dels 100ºC.
Com a exemple de bacteri hipertermòfil tenim Aquifex pyrophilus. Aquests bacteris creixen prop de volcans subaquàtics o fonts hidrotermals.

Termòfils
El més conegut és Thermus aquaticus, descobert en aigües termals al Parc Nacional de Yellowstone. L’ingredient clau per la supervivència de T. aquaticus va ser una variant especial de l’enzim DNA polimerasa. Aquest enzim s’utilitza durant el procés de separar el DNA en dos cadenes. Que normalment l’enllaç és destruït per la calor, T. aquaticus utilitza una variant que serveix en altes temperatures. Aquesta variant (coneguda com Taq polimerasa) és un ingredient clau per la reacció en cadena de la polimerasa (PCR).
Geobacillus stearothermophilus és un bacteri que el podem trobar en el sòl, en fonts termals i sediments oceànics. S’utilitza freqüentment per realitzar proves de validació en el procés d’esterilització, com per exemple l’autoclau.
Psicròfils
Polaromonas vacuolata, psicròfil que trobem en aigües de l’Antàrtic, amb una temperatura òptima de 4ºC, tot i que és capaç de viure en ambients a 0ºC.
En aigües subglaciars, com el llac Vostock a l’Antàrtida, podem trobar bacteris com el Hydrogenophilus thermoluteolus, a temperatures de -3ºC.

En conclusió, els microorganismes que presenten adaptacions a temperatures extremes tenen unes característiques moleculars i membranoses diferents a les dels microorganismes mesòfils. Aquestes diferències, ens són útils en el camp de la biotecnologia, ja que ens ofereixen avantatges per processos industrials. És el cas de la Taq polimerasa, una DNA polimerasa aïllada de Thermus aquaticus, que és capaç de realitzar reaccions bioquímiques a altes temperatures. Aquests enzims són més estables fent que la vida mitjana d’aquestes preparacions enzimàtiques sigui més llarga.

Bibliografia

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2951671/   Publicado en Internet el 28 de febrero 2010, vist el 24-02-13
http://www.teara.govt.nz/en/life-in-hot-springs/page-2  Bruce Mountain. "La vida a les aigües termals - termòfils ', Et Ara - l'Enciclopèdia de Nova Zelanda, actualitzat el 13-juliol-12 
URL: http://www.TeAra.govt.nz/en/life-in-hot-springs/page- 2
Madigan, M T, Martinko, J M, Dunlap, P V & Clark, D P (2009). Brock biología de los microorganismos (12). Pearson Educación.

8 comentarios:

  1. El treball està esbiaixat cap a les adaptacions a temperatures elevades, mentre que de les temperatures baixes se'n parla molt poc. En alguns casos, també hi manca o es tracta molt superficialment l'explicació de perquè una determinada estratègia és útil (per exemple, quin paper juga la girasa inversa, quines proteïnes estabilitzen l'ADN a altes temperatures, perquè els àcids grassos poliinsaturats mantenen fluïda la membrana, com és la monocapa lipídica i quins procariotes la contenen, com actuen les xaperonines, perquè és útil per a la PCR que la polimerasa sigui resistent a temperatures elevades, ...).

    Cal millorar també una mica l'estructuració en apartats i molt especialment introduir figures, vídeos, esquemes, taules, ... és a dir elements gràfics i/o didàctics que podreu incorporar fàcilment al treball gràcies al seu format com a bloc. Aquests elements, igual que la bibliografia, s'ha de referenciar correctament dins el text.

    ResponderEliminar
  2. Per cert, falten també els noms dels autors

    ResponderEliminar
  3. Bones,

    M'ha semblat molt interessant la part dels microorganismes hipertermòfils. M'agraderia saber si aquests s'utilitzen actualment en activitats industrials ja que crec que podrien proporcionar avantatges en la biocatàlisis en condicions extremes, com per exemple poder augmentar la velocitat de les reaccions, augmentar la solubilitat... Heu trobat algun exemple en concret?

    Moltes gràcies,

    Anna Bagó i Mas

    ResponderEliminar
  4. Avaluable
    De quina manera estabilitza el DNA la girasa inversa? Actua tan en hipertermòfils com en psicròfils?
    Merci!

    Marc Rabionet

    ResponderEliminar
  5. Avaluable:

    Hola,

    Es molt interessant el contingut del treball. Però m'ha sorgit curiositat per la funció de les chaperonines. Què vol dir que dobleguen la molècula en la seva forma activa? Sense chaperonines la vida dels hipertermòfils seria possilbe?

    Moltes gràcies,

    Carlos de Tomás Gil (Grup Mitjà 1)

    ResponderEliminar
  6. Comentari avaluable:

    Primer de tot dir que m'ha semblat molt interessant el treball i el trobo molt ben estructurat. Llegint la part dels termòfils parleu d'una espècie concreta d'aquest grup, T. aquaticus que presenta una variant de la DNA polimerasa (Taq polimerasa). Aquesta variant del DNA polimerasa només la presenta aquest microorganisme o la presenten en general tots els components d'aquest grup? I una altra cosa, el grup dels psicròfils al treballar a un rang de temperatures més baix també necessiten una variant de la DNA polimerasa?

    Moltes gràcies,

    Marina Carrasco Vila.

    ResponderEliminar
  7. Comentari avaluable:

    Hola. El vostre treball està molt be però m'agradaria saber més coses sobre els organismes psicròfils. Tenen alguna propietat, gen o proteina que es pugui aillar i utilitzar per al nostre benefici? (Ja sigui produir algun transgènic, proteïnes d'ús comercial, etc.)

    Moltes Gràcies!


    Marc Montero

    ResponderEliminar